توضیحات
سرفصلهای دوره تحلیل دادههای NGS
1. مقدمهای بر ژنتیک و بیوانفورماتیک:
آشنایی با مفاهیم پایه برای افراد بدون پیشزمینه در علوم زیستی
2. پایگاههای داده ژنتیکی:
معرفی دیتابیسهای آنلاین و نحوه جستجو و استخراج اطلاعات
3. اصول تحلیل دادههای NGS:
مروری بر مفاهیم کلیدی در پردازش دادههای توالییابی نسل جدید
4. ساختار و فرمتهای دادههای NGS:
بررسی فایلهای FASTQ، BAM، VCF و روش کار با آنها
5. پلتفرمهای تحلیل دادههای NGS:
آشنایی با ابزارهای آنلاین و بدون کدنویسی برای پردازش دادهها
6. کار عملی روی دادههای WES/WGS:
6-1. پردازش داده FASTQ
اجرای مراحل تحلیل روی دادههای واقعی
6-2. فیلترینگ و تفسیر جهشها:
استخراج اطلاعات معنادار از فایلهای VCF
6-3. آنوتیشن و پایگاههای داده مرتبط:
حاشیه نویسی و تفسیر بیولوژیکی جهشهای شناساییشده
6-4. تحلیل موردی بر دادههای سرطان:
تمرین عملی بر روی دادههای واقعی بیماران
7. کار عملی روی دادههای RNA-seq:
7-1. پردازش فایل FASTQ
7-2. همترازسازی (Mapping)
7-3.شمارش (counting)
7-4.تحلیل بیان افتراقی (DGE) و تفسیر نتایج
8. جمعبندی و مسیر ادامه یادگیری:
مرور آموختهها و معرفی منابع معتبر برای مطالعه بیشتر
