زیستا بیوتک

دوره جامع آنالیز داده‌های NGS: تحت وب و بدون برنامه نویسی

دوره جامع آنالیز داده های توالی یابی نسل جدید(Next Generation Sequencing)، با تمرکز بر توالی یابی کل اگزوم (Whole Exome Sequencing)، توالی یابی کل ژنوم (Whole Genome Sequencing) و RNA Sequencing همگی با محوریت کنسر ژنومیکس: تحت پلتفرم گلکسی، بدون نیاز به پیش زمینه زیستی و دانش برنامه نویسی.

 

توجه: در این دوره بدون نیاز به دانش تخصصی پیشین، به صورت گام به گام با روش‌های تحلیل داده‌های NGS آشنا خواهید شد. هدف این دوره ایجاد تسلط بر مفاهیم علمی و کاربردی در فضایی ساده و قابل فهم است تا در صورت تمایل، مسیر یادگیری خود را در سطوح پیشرفته تر ادامه دهید.

  • پلتفرم آنالیز داده‌ها در این دوره محیط تحت وب Galaxy می‌باشد و از برنامه نویسی استفاده نمی‌شود.

 

*** تمام دوره‌های آموزشی زیستا بیوتک دارای پشتیبانی و منتورینگ فعال هستند، به صورتی که شما می‌توانید سوالات مرتبط خود را با اساتید دوره آموزشی مطرح کنید. جهت عضویت در کانال منتورینگ، در بخش ارتباط با ما، به پشتیبانی تلگرام زیستا بیوتک پیام ارسال کنید ***

 

مدرس: خانم نسیم شهسواریان
  • کارشناس ارشد زیست شناسی سلولی و تکوینی – بنیان گزار گروه تخصصی بیوانفورماتیک زیستا
  • محقق، مدرس و آنالیزور داده های NGS و سیستم بیولوژی

 

  • حتما بخش توضیحات تکمیلی را به دقت مطالعه نمائید.

کد محصول: وجود ندارد

ویژگی‌های محصول

  • پیش نیاز: بدون نیاز به پیش زمینه علوم زیستی و دانش برنامه نویسی(مطالب از پایه تدریس می‌شوند)
  • پلتفرم ارائه: اسپات پلیر(spotplayer)
  • توضیحات نصب اسپات پلیر: نرم افزار اسپات پلیر را با توجه به نوع سیستم عامل خود می‌توانید از طریق لینک‌هایی که در پروفایل کاربری خود مشاهده می‌کنید دانلود نمائید.
    • توجه: پس از خرید دوره، لایسنس در پروفایل کاربری شما ایجاد می‌شود و فقط کافی است لایسنس را در قسمت مربوطه در نرم افزار اسپات پلیر وارد کنید. حتما توجه داشته باشید که فقط در یک دستگاه می‌توانید لایسنس را وارد نمائید. در غیر اینصورت لایسنس باطل می‌شود.

امتیاز کاربران

بدون دیدگاه

محصول در دسترس نیست

تومان1.800.000

ناموجود

توضیحات

سرفصل‌های دوره تحلیل داده‌های NGS

 
1. مقدمه‌ای بر ژنتیک و بیوانفورماتیک:
آشنایی با مفاهیم پایه برای افراد بدون پیش‌زمینه در علوم زیستی
2. پایگاه‌های داده ژنتیکی:
معرفی دیتابیس‌های آنلاین و نحوه جستجو و استخراج اطلاعات
3. اصول تحلیل داده‌های NGS:
مروری بر مفاهیم کلیدی در پردازش داده‌های توالی‌یابی نسل جدید

4. ساختار و فرمت‌های داده‌های NGS:
بررسی فایل‌های FASTQ، BAM، VCF و روش کار با آن‌ها

5. پلتفرم‌های تحلیل داده‌های NGS:
آشنایی با ابزارهای آنلاین و بدون کدنویسی برای پردازش داده‌ها
 
6. کار عملی روی داده‌های WES/WGS:
 
6-1. پردازش داده FASTQ
اجرای مراحل تحلیل روی داده‌های واقعی
6-2. فیلترینگ و تفسیر جهش‌ها:
استخراج اطلاعات معنادار از فایل‌های VCF
6-3. آنوتیشن و پایگاه‌های داده مرتبط:
حاشیه نویسی و تفسیر بیولوژیکی جهش‌های شناسایی‌شده
6-4. تحلیل موردی بر داده‌های سرطان:
تمرین عملی بر روی داده‌های واقعی بیماران
 
7. کار عملی روی داده‌های RNA-seq:
 

7-1. پردازش فایل FASTQ

7-2. همترازسازی (Mapping)
7-3.شمارش (counting)
7-4.تحلیل بیان افتراقی (DGE) و تفسیر نتایج

 
8. جمع‌بندی و مسیر ادامه یادگیری:
مرور آموخته‌ها و معرفی منابع معتبر برای مطالعه بیشتر

توضیحات تکمیلی

پیش نیاز

بدون نیاز به پیش زمینه علوم زیستی و دانش برنامه نویسی(مطالب از پایه تدریس می‌شوند)

پلتفرم ارائه

اسپات پلیر(spotplayer)

توضیحات نصب اسپات پلیر

نرم افزار اسپات پلیر را با توجه به نوع سیستم عامل خود می‌توانید از طریق لینک‌هایی که در پروفایل کاربری خود مشاهده می‌کنید دانلود نمائید.

توجه

پس از خرید دوره، لایسنس در پروفایل کاربری شما ایجاد می‌شود و فقط کافی است لایسنس را در قسمت مربوطه در نرم افزار اسپات پلیر وارد کنید.
حتما توجه داشته باشید که فقط در یک دستگاه می‌توانید لایسنس را وارد نمائید. در غیر اینصورت لایسنس باطل می‌شود.