زیستا بیوتک
پروفایل کاربری
دوره جامع آنالیز جهش‌ها از دیتابیس TCGA
دوره‌های تخصصی

دوره جامع آنالیز جهش‌ها از دیتابیس TCGA

معرفی دوره

داده‌های جهشی یکی از مهم‌ترین و گسترده‌ترین انواع داده در پروژه TCGA (The Cancer Genome Atlas) هستند که در پژوهش‌های ژنومی سرطان کاربرد فراوانی دارند. در این دوره کاربردی و پروژه‌محور، شما یاد می‌گیرید چگونه با استفاده از ابزارهای پیشرفته‌ای مانند maftools و cBioPortalData داده‌های جهشی سرطان را تحلیل، مصورسازی و تفسیر کنید.

این دوره نیاز به داده خام ندارد و شما مستقیماً از فایل‌های MAF یا VCF پروژه‌های معتبر جهانی استفاده خواهید کرد. اگر می‌خواهید نقش جهش‌های ژنی را در سرطان شناسایی کنید یا در پروژه‌های خود از داده‌های واقعی استفاده نمایید، این دوره مخصوص شماست. این دوره به‌ویژه برای پژوهشگرانی طراحی شده است که با زبان برنامه نویسی R آشنا هستند و به دنبال تحلیل‌های پیشرفته روی داده‌های جهش و اطلاعات بالینی کنسر ژنومیکس هستند.

*** تمام دوره‌های آموزشی زیستا بیوتک دارای پشتیبانی و منتورینگ فعال هستند، به صورتی که شما می‌توانید سوالات مرتبط خود را با اساتید دوره آموزشی مطرح کنید. جهت عضویت در کانال منتورینگ، در بخش ارتباط با ما، به پشتیبانی تلگرام زیستا بیوتک پیام ارسال کنید ***

پیشنهاد زیستا بیوتک به شما شرکت در 3 دوره‌ی (زبان برنامه نویسی R)، (تحلیل داده‌هاي ترانسكريپتوم TCGA) و (تحليل داده هاي جهش TCGA) بصورت منسجم و بدنبال هم می‌باشد. زیرا با دنبال کردن این 3 دوره آموزشی شما به تسلط مناسبی در زبان برنامه نویسی R و کاربرد آن در جهت استخراج و انالیز داده‌هاي زيستي از ديتابيس هاي مربوطه خواهيد رسيد.

برای ترتیب مشاهده دوره‌ها نیز توصیه می‌شود حتما در ابتدا دوره R را مطالعه کنید(پیش نیاز دوره‌های ترانسکریپتوم و جهش)، سپس به خوبی می‌توانید از دوره‌های بررسی بیان ژن و جهش بهره‌مند شوید .

 

مدرس: خانم مهسا احسانی فرد

  • کارشناس ارشد ژنتیک
  • آنالیزور داده های زیست پزشکی سرطان
  • مشاور پژوهشی پایان نامه ها و پروژه های دانشجویی در زمینه ی سیستم بیولوژی
  • مشاور طراحی workflow و pipeline پژوهشی
  • فریلنسر در زمینه ی زیست پزشکی محاسباتی
  • مدرس برنامه نویسی R و زیست شناسی سامانه ای

حتما بخش توضیحات تکمیلی را به دقت مطالعه نمائید.

کد محصول: وجود ندارد

ویژگی‌های محصول

  • پلتفرم ارائه: اسپات پلیر(spotplayer)
  • پیش نیاز: زبان برنامه نویسی R - درک پایه ای از زیست شناسی مولکولی
  • توضیحات نصب اسپات پلیر: نرم افزار اسپات پلیر را با توجه به نوع سیستم عامل خود می‌توانید از طریق لینک‌ هایی که در پروفایل کاربری خود مشاهده می‌کنید دانلود نمائید.
    • توجه: پس از خرید دوره، لایسنس در پروفایل کاربری شما ایجاد می‌شود و فقط کافی است لایسنس را در قسمت مربوطه در نرم افزار اسپات پلیر وارد کنید. حتما توجه داشته باشید که فقط در یک دستگاه می‌توانید لایسنس را وارد نمائید. در غیر اینصورت لایسنس باطل می‌شود.

امتیاز کاربران

بدون دیدگاه

محصول در دسترس نیست

تومان1.500.000

ناموجود

توضیحات توضیحات تکمیلی ویدیوی محصول

توضیحات

سرفصل‌های آموزشی دوره

  • آشنایی با انواع جهش‌های ژنی و منابع معتبر جهانی برای تحلیل آن‌ها

  • دریافت و پردازش داده‌های جهشی از TCGA و cBioPortal

  • معرفی و کاربرد ابزارهای maftools و cBioPortalData

  • تحلیل فرکانس جهش در ژن‌های مختلف (Gene Mutation Frequency)

  • بررسی جهش‌های خاص و رایج در سرطان‌ها

  • تحلیل Co-occurrence یا هم‌وقوعی جهش‌ها در ژن‌های مختلف

  • مصورسازی داده‌ها با نمودارهای Mutation، Oncoplot و Lollipop

  • بررسی ارتباط جهش‌های ژنی با بقا و پیش‌آگهی بیماران

  • تحلیل اختصاصی ژن‌های جهش‌یافته و مسیرهای بیولوژیکی درگیر

اهمیت آنالیز جهش در سرطان

تحلیل جهش‌های ژنی یکی از ارکان اصلی تحقیقات ژنومی سرطان است. این تحلیل به ما کمک می‌کند:

  • ژن‌های درایور (Driver genes) را شناسایی کنیم؛

  • فرکانس جهش‌ها در ژن‌های خاص را در انواع سرطان‌ها بررسی کنیم؛

  • اهداف درمانی بالقوه را اولویت‌بندی کنیم؛

  • مسیرهای مولکولی دخیل در سرطان را کشف و تحلیل کنیم؛

  • و حتی در طراحی درمان‌های شخصی‌سازی‌شده و بالینی مشارکت کنیم.

با استفاده از داده‌های TCGA، شما می‌توانید ببینید کدام ژن‌ها در سرطان خاصی بیشترین نرخ جهش را دارند و این اطلاعات چگونه بر درمان و بقا اثر می‌گذارند.

ابزارهای مورد استفاده

  •  maftools (پکیج قدرتمند تحلیل فایل‌های MAF در R)

  •  cBioPortalData (پلتفرم تحت Bioconductor برای آنالیز داده‌های cBioPortal)

  •  COSMIC، ClinVar و سایر دیتابیس‌های تفسیر جهش‌ها

مخاطبان این دوره

  • پژوهشگران و دانشجویان ژنتیک، بیوانفورماتیک و تمام گرایش‌های علوم بیولوژی

  • فعالان حوزه NGS و آنالیز داده‌های ژنومی

  • افرادی که قصد استفاده از داده‌های معتبر جهانی برای پروژه‌های شخصی خود را دارند

  • علاقه‌مندان به تفسیر بالینی جهش‌های ژنی در پروژه‌های کنسر ژنومیکس

توضیحات تکمیلی

پلتفرم ارائه

اسپات پلیر(spotplayer)
پیش نیاز

زبان برنامه نویسی R – درک پایه ای از زیست شناسی مولکولی
توضیحات نصب اسپات پلیر

نرم افزار اسپات پلیر را با توجه به نوع سیستم عامل خود می‌توانید از طریق لینک‌ هایی که در پروفایل کاربری خود مشاهده می‌کنید دانلود نمائید.
توجه

پس از خرید دوره، لایسنس در پروفایل کاربری شما ایجاد می‌شود و فقط کافی است لایسنس را در قسمت مربوطه در نرم افزار اسپات پلیر وارد کنید.
حتما توجه داشته باشید که فقط در یک دستگاه می‌توانید لایسنس را وارد نمائید. در غیر اینصورت لایسنس باطل می‌شود.