آموزش زبان R برای تحلیل داده‌های زیستی: شروعی ساده برای مبتدی‌ها

یکی از جذاب‌ترین بخش‌های کار با R توانایی رسم نمودارهای دقیق و حرفه‌ای است. بسته‌ای به نام ggplot2 این امکان را به شما می‌دهد که نمودارهای ستونی، جعبه‌ای، نقطه‌ای، پراکندگی و… را به سادگی طراحی کنید.

تحلیل داده‌های زیستی با R و Bioconductor

برای تحلیل‌های زیستی پیشرفته‌تر، پروژه‌ای به نام Bioconductor وجود دارد که صدها بسته (package) مخصوص علوم زیستی در R را شامل می‌شود.

با Bioconductor می‌توانید کارهایی مثل آنالیز  RNA-seq، شناسایی ژن‌های متفاوت بیان‌شده، بررسی جهش‌های ژنی، تحلیل متیلاسیون DNA، مقایسه بین نمونه‌های سرطانی و سالم و بسیاری تحلیل‌های دیگر را انجام دهید.

یکی از بسته‌های معروف در این حوزه DESeq2 است که برای آنالیز آماری داده‌های RNA-seq استفاده می‌شود.

در کنار آن بسته‌هایی مثل edgeR، limma، maftools و TCGAbiolinks نیز بسیار محبوب هستند.

آیا R برای من مناسبه؟

اگر شما دانشجوی رشته‌هایی مثل ژنتیک، انواع گرایش‌های زیست‌شناسی، بیوتکنولوژی، پزشکی، داروسازی، دامپزشکی، مهندسی کشاورزی و …هستید و علاقه دارید تحلیل داده‌ها را خودتان انجام دهید، R یکی از بهترین زبان‌ها برای شروع است.

حتی اگر پیش‌زمینه‌ای از برنامه‌نویسی ندارید، باز هم یادگیری R ممکن است. با کمی تمرین و مسیر آموزشی مناسب، خیلی زود می‌توانید پروژه‌های واقعی خود را تحلیل کنید.

مسیر یادگیری زبان R برای حوزه‌های علوم بیومدیکال

برای یادگیری R لازم نیست همه چیز را یک‌باره بدانید. مسیر یادگیری می‌تواند به صورت مرحله‌ای باشد:

• در مرحله اول، با نصب R و RStudio و اجرای کدهای ساده شروع می‌کنید.
• در مرحله دوم، با ساختار داده‌ها، وارد کردن فایل‌های CSV یا Excel، فیلتر کردن داده‌ها و انجام محاسبات آماری آشنا می‌شوید.
• در مرحله سوم، یاد می‌گیرید که چطور با بسته‌هایی مثل ggplot2 نمودارهای علمی بکشید.
• و در نهایت، سراغ تحلیل‌های واقعی مثل RNA-seq یا داده‌های TCGA می‌روید.

مهم‌ترین نکته در یادگیری R این است که پروژه‌محور یاد بگیرید. یعنی همراه با یک پروژه واقعی (مثلاً داده‌های بیان ژن) آموزش ببینید. 

جمع‌بندی

یادگیری زبان R یکی از مهم‌ترین مهارت‌هایی است که هر پژوهشگر زیستی باید به آن مسلط باشد. با R نه‌تنها می‌توانید داده‌های تحقیقاتی خود را با دقت تحلیل کنید، بلکه می‌توانید نتایجی قابل اعتماد برای انتشار در مقالات علمی به‌دست آورید.

از همان مراحل ابتدایی یادگیری، شما وارد دنیایی از ابزارهای رایگان، مستندات قوی و جامعه‌ای فعال از محققین می‌شوید که همه چیز را برای رشد سریع شما فراهم کرده‌اند.

شروع آموزش R در زیستا بیوتک

اگر دوست دارید R را با روشی ساده، پروژه‌محور و مخصوص نیازهای زیست‌شناسان یاد بگیرید، ما در زیستا بیوتک یک دوره جامع برای شما طراحی کرده‌ایم. این دوره بدون نیاز به هیچ پیش‌زمینه‌ای، شما را گام‌به‌گام به تحلیل داده‌های واقعی می‌رساند.

مشاهده دوره آموزش زبان برنامه نویسی R برای علوم بیومدیکال در زیستا بیوتک